More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2643 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.58 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.82 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  29.68 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  36.84 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.36 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  34.1 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.49 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  36.54 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  29.95 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  29.95 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.68 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  29.22 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  36.18 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  35.68 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.77 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  35.92 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  33.82 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.85 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  34.16 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  33.65 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  32.09 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.82 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  32.38 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.27 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  28.57 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.58 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.01 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  34.9 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  34.9 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.5 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  33.8 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.24 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.89 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.47 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  36.56 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.59 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  31.63 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  37.84 
 
 		 291 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.24 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.82 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  33.86 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.41 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.02 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  33.67 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  32.08 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.55 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.71 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.23 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.95 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.8 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.5 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 217 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  25.44 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  37.23 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.09 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  28.17 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.13 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  27.56 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  31.4 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.11 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.19 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  30.33 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.83 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.98 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.46 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>