42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2632 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  36.27 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  36.21 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  39.02 
 
 		 374 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  30.65 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1526 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  34.62 
 
 		 1611 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  35.19 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  33.09 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  26.69 
 
 		 797 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  29.87 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  27.71 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 911 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0080  putative ATP/GTP binding protein  25 
 
 		 131 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  26.42 
 
 		 413 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  23.15 
 
 		 859 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  23.68 
 
 		 1048 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  32.95 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  35.16 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 785 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  24.3 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  25.93 
 
 		 897 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  24.48 
 
 		 829 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  27.36 
 
 		 900 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  27.56 
 
 		 544 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  24.07 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  32.97 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  25.42 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  28.07 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  31.03 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 540 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  26.67 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  22.92 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 681 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28 
 
 		 1656 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  26.23 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  26.81 
 
 		 384 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.38 
 
 		 1348 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.58 
 
 		 947 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  23.15 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.85 
 
 		 825 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>