More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2558 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  64.67 
 
 		 469 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  92.74 
 
 		 469 aa  922    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  65.52 
 
 		 469 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  69.98 
 
 		 486 aa  690    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  77.78 
 
 		 469 aa  787    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  65.74 
 
 		 471 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  82.26 
 
 		 469 aa  831    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  82.26 
 
 		 469 aa  831    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  64.88 
 
 		 469 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  85.62 
 
 		 470 aa  852    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  71.49 
 
 		 477 aa  699    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  70.45 
 
 		 469 aa  705    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  78.42 
 
 		 469 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1344  glutamine synthetase, type I  65.17 
 
 		 469 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  96.79 
 
 		 469 aa  953    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  92.09 
 
 		 469 aa  916    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  75.43 
 
 		 468 aa  749    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  81.62 
 
 		 469 aa  827    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0147  L-glutamine synthetase  65.38 
 
 		 469 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0281822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  79.91 
 
 		 471 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  85.41 
 
 		 470 aa  849    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  80.34 
 
 		 469 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  64.88 
 
 		 469 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  66.88 
 
 		 469 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  66.67 
 
 		 470 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 469 aa  981    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  66.03 
 
 		 469 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1515  L-glutamine synthetase  63.73 
 
 		 468 aa  635    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  65.24 
 
 		 468 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  95.95 
 
 		 469 aa  952    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  82.26 
 
 		 469 aa  832    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  80.34 
 
 		 469 aa  801    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1216  glutamine synthetase, type I  85.9 
 
 		 469 aa  833    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  98.51 
 
 		 469 aa  972    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  64.88 
 
 		 469 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  93.16 
 
 		 469 aa  927    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  78.21 
 
 		 469 aa  793    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  64.88 
 
 		 469 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  66.67 
 
 		 468 aa  658    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  66.38 
 
 		 470 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  79.06 
 
 		 469 aa  799    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  64.88 
 
 		 469 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  66.23 
 
 		 468 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  74.57 
 
 		 469 aa  751    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1330  L-glutamine synthetase  71.65 
 
 		 467 aa  711    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.523028  normal  0.654119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  80.34 
 
 		 469 aa  802    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  64.67 
 
 		 469 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0427  glutamine synthetase, type I  85.04 
 
 		 469 aa  830    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  77.99 
 
 		 469 aa  787    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  67.17 
 
 		 468 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1780  glutamine synthetase, type I  65.38 
 
 		 469 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  64.88 
 
 		 471 aa  634  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  64.73 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  63.44 
 
 		 473 aa  632  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  64.24 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  64.24 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  63.81 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  63.81 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  64.67 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  64.88 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1109  glutamine synthetase, type I  63.6 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  64.74 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  64.03 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  63.6 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  63.17 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1189  L-glutamine synthetase  63.38 
 
 		 471 aa  621  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.868262  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  63.6 
 
 		 472 aa  621  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  63.17 
 
 		 471 aa  621  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  63.38 
 
 		 471 aa  623  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  63.6 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  64.01 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  62.74 
 
 		 471 aa  621  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  62.96 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  62.96 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  62.31 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0736  glutamine synthetase, type I  62.45 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00218328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  62.96 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  62.74 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  63.58 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  63.17 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  62.74 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  62.96 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  62.74 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  62.96 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3719  glutamine synthetase  63.38 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.606524  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  62.96 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  62.96 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  63.81 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>