More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2481 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  89 
 
 		 500 aa  919    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  64.46 
 
 		 498 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  77.6 
 
 		 500 aa  778    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 500 aa  1005    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  80.96 
 
 		 499 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  92.6 
 
 		 500 aa  892    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  79.8 
 
 		 500 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  76.35 
 
 		 499 aa  759    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  59.27 
 
 		 497 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  61.17 
 
 		 495 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  62.2 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  63.3 
 
 		 496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  60.96 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  57.46 
 
 		 539 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  58.22 
 
 		 497 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  58.01 
 
 		 497 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  59.76 
 
 		 542 aa  551  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  57.43 
 
 		 503 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  61.57 
 
 		 497 aa  548  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  57.49 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  57.6 
 
 		 497 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  57.97 
 
 		 497 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  57.97 
 
 		 497 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  59.96 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  65.31 
 
 		 497 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  54.78 
 
 		 500 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  52.32 
 
 		 487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  50.75 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  52.82 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  50.82 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  49.34 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  49.69 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  50.45 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  48.22 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  45.1 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  53 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  45.66 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  45.47 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  45.6 
 
 		 489 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  42.57 
 
 		 508 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  43.82 
 
 		 533 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  44.23 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 491 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  40.33 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  40.33 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  40.33 
 
 		 510 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 		 518 aa  349  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 		 510 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  42.09 
 
 		 511 aa  346  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  41.28 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  44.61 
 
 		 506 aa  343  5e-93  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  43.64 
 
 		 496 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  41.46 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  40.97 
 
 		 496 aa  333  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  43.76 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  43.76 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  44.13 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  48.3 
 
 		 496 aa  323  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  41.43 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  42.23 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  46.62 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  43.47 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.47 
 
 		 491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  42.36 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  43.33 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  41.61 
 
 		 495 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  45.76 
 
 		 500 aa  316  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  43.35 
 
 		 556 aa  316  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 		 496 aa  317  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  43.17 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  41.58 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  42.52 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  47.97 
 
 		 536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  41.72 
 
 		 498 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  45.52 
 
 		 486 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  40.48 
 
 		 495 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 		 496 aa  312  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 		 488 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  48.41 
 
 		 497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  51.43 
 
 		 503 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  48.82 
 
 		 536 aa  310  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  42.51 
 
 		 507 aa  310  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2116  leucyl aminopeptidase  42.69 
 
 		 479 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  42.6 
 
 		 482 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  42.18 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3539  leucyl aminopeptidase  44.29 
 
 		 525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2169  leucyl aminopeptidase  43.63 
 
 		 510 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  42.45 
 
 		 508 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  47.89 
 
 		 511 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  43.15 
 
 		 486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  43.09 
 
 		 508 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1942  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189087  normal  0.0962979 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  40.05 
 
 		 495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>