More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2178 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  100 
 
 		 415 aa  780    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  68.69 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  70.8 
 
 		 407 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  63.7 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  63.7 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  59.85 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  63.68 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  58.23 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  57.72 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.95 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.95 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  61.13 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  62.24 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  58.78 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  56.34 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  56.66 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  56.51 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  55.91 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  58.22 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  54.37 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  53.33 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  56.38 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  56.38 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  56.38 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  57.07 
 
 		 403 aa  360  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  58.15 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  54.83 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  49.49 
 
 		 393 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  55.81 
 
 		 398 aa  355  6.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  60.97 
 
 		 392 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  55.92 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  57.65 
 
 		 404 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  62.09 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.33 
 
 		 411 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.33 
 
 		 411 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  49.87 
 
 		 397 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  51.23 
 
 		 409 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  59.95 
 
 		 392 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  54.93 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  55.61 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  49.62 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  50.75 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  56.48 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  55.36 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  55.96 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  62.84 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  50.25 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  50.25 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  50.25 
 
 		 393 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.83 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  50 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  53.71 
 
 		 430 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.27 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  49.37 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  49.75 
 
 		 393 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.96 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  63.85 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  50 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.55 
 
 		 404 aa  325  8.000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  53.71 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  54.24 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  55.01 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.96 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  51.98 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  48.72 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  47.01 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.61 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  43.7 
 
 		 383 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  52.11 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  55.61 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  41.44 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  44.89 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  52.74 
 
 		 330 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  43.29 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  41.18 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  43.82 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  42.98 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  46.02 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  44.33 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  43.04 
 
 		 378 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  44.16 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  45.63 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  43.54 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  43.38 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  43.37 
 
 		 418 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.59 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  43.37 
 
 		 418 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  43.77 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  43.33 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  47.04 
 
 		 381 aa  229  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  42.75 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  40.11 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  49.75 
 
 		 416 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  41.04 
 
 		 402 aa  200  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  35.86 
 
 		 493 aa  192  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  54.09 
 
 		 158 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.46 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.01 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.3 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  30.79 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>