184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1900 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1900  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6278  putative maleylacetoacetate isomerase (MAAI) (glutathione S- transferase)  83.33 
 
 		 217 aa  357  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  73.49 
 
 		 217 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  73.02 
 
 		 217 aa  333  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.03 
 
 		 221 aa  327  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  69.77 
 
 		 217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  68.98 
 
 		 218 aa  321  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.08 
 
 		 217 aa  311  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  67.74 
 
 		 219 aa  308  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.06 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  64.95 
 
 		 218 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  62.62 
 
 		 218 aa  297  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.59 
 
 		 219 aa  291  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  65.73 
 
 		 239 aa  290  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.73 
 
 		 239 aa  290  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.73 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  64.65 
 
 		 220 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3614  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.57 
 
 		 220 aa  287  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.922528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1840  glutathione S-transferase-like  61.4 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.98 
 
 		 216 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0624  Glutathione S-transferase domain protein  63.26 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.28 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4030  putative glutathione-S-transferase protein  60.29 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3775  putative glutathione-S-transferase protein  60.29 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4069  putative glutathione-S-transferase protein  60.29 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1488  putative glutathione-S-transferase protein  58.41 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0682  putative glutathione-S-transferase protein  58.5 
 
 		 218 aa  234  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.994031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.85 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.85 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.85 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.29 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.29 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.29 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.29 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.37 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  46.41 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  48.36 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.97 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  46.31 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  47.14 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.14 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  44.34 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.62 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  47.78 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  44.44 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  46.67 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.67 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.67 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  46.12 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  48.28 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  49.51 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  45.1 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.63 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.32 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  45.28 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  45.32 
 
 		 229 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.32 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  41.2 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  41.98 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  44.19 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  42.79 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  40.45 
 
 		 234 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  43.19 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  41.98 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0613  Glutathione S-transferase domain  43.84 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  38.99 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  37.91 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  40.48 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  42.72 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.38 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.89 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.45 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0241  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.59 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  41.51 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.73 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.87 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  36.97 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  40.39 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  42.65 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.49 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0580  glutathione S-transferase-like  40.37 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.02 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  35.92 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.44 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.08 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  39.34 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.02 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.18 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2405  Glutathione S-transferase domain protein  43.07 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1347  glutathione S-transferase family protein  41.38 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114443  hitchhiker  0.00114308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  37.85 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  39.8 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>