35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1854 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0677881  decreased coverage  0.000466898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4110  hypothetical protein  96.2 
 
 		 81 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1348  hypothetical protein  85.9 
 
 		 82 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0440687  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3180  hypothetical protein  80.77 
 
 		 83 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.609523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4706  hypothetical protein  74.36 
 
 		 80 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2558  hypothetical protein  78.08 
 
 		 83 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15069  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0487  hypothetical protein  72.22 
 
 		 79 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0238361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0531  hypothetical protein  69.86 
 
 		 81 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0900  hypothetical protein  66.23 
 
 		 78 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.549897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0436  hypothetical protein  76.47 
 
 		 83 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3044  hypothetical protein  76.47 
 
 		 83 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0213  hypothetical protein  71.43 
 
 		 83 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0193  hypothetical protein  71.43 
 
 		 83 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1484  hypothetical protein  69.86 
 
 		 81 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0905303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1689  hypothetical protein  79.75 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6609  hypothetical protein  73.13 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.642327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6073  hypothetical protein  73.13 
 
 		 82 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0423  hypothetical protein  70.59 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0629  hypothetical protein  68.06 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4536  hypothetical protein  66.2 
 
 		 74 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.178534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4184  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.948994  normal  0.7469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3874  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21436  normal  0.053171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1488  hypothetical protein  65.22 
 
 		 78 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0638  hypothetical protein  61.33 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0071  hypothetical protein  58.82 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4331  hypothetical protein  63.77 
 
 		 75 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.014521  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0916  hypothetical protein  57.89 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0401  hypothetical protein  54.93 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1460  hypothetical protein  60.56 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0111  hypothetical protein  60.56 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0058  hypothetical protein  57.75 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2228  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.848088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0441  hypothetical protein  50.77 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.183458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0518  hypothetical protein  52.31 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1206  hypothetical protein  50.72 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.827802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>