More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1676 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  808    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  85.19 
 
 		 413 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  91.48 
 
 		 411 aa  758    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  92.7 
 
 		 411 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 389 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 411 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  44 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  43.41 
 
 		 528 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 410 aa  295  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  41.29 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  40.45 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  39.55 
 
 		 414 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  43.13 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  43.13 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  43.08 
 
 		 402 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  40.24 
 
 		 413 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 410 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  38.67 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  43.96 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  41.82 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  38.52 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  43.27 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 410 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 408 aa  272  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 417 aa  272  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  39 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  43.08 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 410 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 412 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 410 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 410 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  42.82 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 409 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  38.04 
 
 		 430 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  35.78 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 417 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  35 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  34.99 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  35.09 
 
 		 421 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  29.67 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 422 aa  126  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 436 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.87 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.91 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 431 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.38 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>