More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1608 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  100 
 
 		 332 aa  668    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  91.87 
 
 		 332 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  92.7 
 
 		 331 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  84.74 
 
 		 345 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  82.55 
 
 		 346 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  83.5 
 
 		 334 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  78.59 
 
 		 335 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  71.62 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  37.38 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  35.91 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  37.85 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.11 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  38.03 
 
 		 313 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  37.18 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  35.95 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  38.05 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  35.51 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  34.8 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  35.19 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  34.48 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  34.48 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  35.08 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  38.68 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  35.83 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  35.87 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  36.27 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  34.58 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  34.89 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  34.89 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  32.8 
 
 		 354 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  34.94 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  34.62 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  34.27 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  34.6 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 		 355 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  30.55 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  34.8 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  34.66 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  33.65 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  32.36 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 		 360 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  33.43 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  34.41 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.99 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  36.34 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  33.23 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  32.47 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  32.47 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  34.92 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  33.23 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  33.23 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  32.06 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  30.42 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 		 327 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.68 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.05 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.36 
 
 		 288 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.13 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.36 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.36 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  31.49 
 
 		 649 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  30.84 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  36.78 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  30.5 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  31.27 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  38.1 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.26 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  32.69 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  36.58 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.65 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  31.92 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  31.97 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>