More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1577 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 287 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  94.43 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  89.9 
 
 		 287 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  77.7 
 
 		 287 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  77 
 
 		 287 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  75.26 
 
 		 285 aa  454  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  62.59 
 
 		 289 aa  394  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  64.95 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  61.32 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  57.49 
 
 		 284 aa  358  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  60.28 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  62.06 
 
 		 283 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1157  formyltetrahydrofolate deformylase  60.71 
 
 		 284 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  59.5 
 
 		 284 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 286 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  58.06 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  53.71 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 282 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  53.68 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.4 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  53.47 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 		 289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 294 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  54.36 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  52.76 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 288 aa  298  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  53.82 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  51.94 
 
 		 288 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 		 303 aa  298  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  53.66 
 
 		 288 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 294 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  52.07 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  51.38 
 
 		 294 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 		 285 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  53.98 
 
 		 293 aa  294  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  53.71 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  52.07 
 
 		 294 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  51.03 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 284 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 282 aa  292  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  52.07 
 
 		 294 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  51.03 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  51.4 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 283 aa  292  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 283 aa  292  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 284 aa  292  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 289 aa  291  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  51.4 
 
 		 294 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 		 282 aa  292  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 294 aa  291  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 294 aa  291  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 288 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 294 aa  291  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  52.94 
 
 		 293 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  52.94 
 
 		 293 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.94 
 
 		 293 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 307 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  53.33 
 
 		 288 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 282 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  52.6 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  52.6 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  52.6 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  52.6 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  51.9 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  47.42 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  52.46 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  47.72 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>