More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1547 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 397 aa  795    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 374 aa  96.3  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 359 aa  93.2  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  28.61 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.33 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 774 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  20 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.58 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.94 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  28.4 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 823 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 748 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.36 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  35.77 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.7 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 765 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>