More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1490 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  845    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  56.97 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  59.09 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 389 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 395 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  27.95 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  27.3 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  28.97 
 
 		 407 aa  87  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  27.41 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.19 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  26.34 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.92 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  21.75 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  36.67 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  21.55 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  28.11 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  26.43 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  25.55 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  25.55 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  28.3 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  25 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  28.08 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  25.81 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  25.86 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.15 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  30.33 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  28.35 
 
 		 912 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  26.86 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.27 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  29.53 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  29.53 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  25.94 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.17 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>