More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1304 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 271 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.88 
 
 		 271 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  90.41 
 
 		 271 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.86 
 
 		 274 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.11 
 
 		 273 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  39.7 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  37.78 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.93 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 264 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.53 
 
 		 662 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  37.83 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 		 264 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.59 
 
 		 662 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.54 
 
 		 661 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  37.68 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.95 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 288 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.65 
 
 		 659 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>