More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1288 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  100 
 
 		 313 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  91.37 
 
 		 313 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  87.54 
 
 		 313 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  77.56 
 
 		 313 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  58.6 
 
 		 320 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  53.63 
 
 		 323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  54.09 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  52.58 
 
 		 317 aa  315  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  52.88 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  52.23 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  54.29 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  53.63 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  53.65 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  51.59 
 
 		 319 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  50.32 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  52.85 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  51.88 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.16 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  49.52 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  46.69 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  43.85 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  42.5 
 
 		 348 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.74 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  43.95 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  42.02 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  43.79 
 
 		 352 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  44.06 
 
 		 342 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  39.69 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.38 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.98 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  42.54 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  40.69 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.75 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  43.17 
 
 		 333 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  39.81 
 
 		 344 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.63 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  38.53 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  39.88 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  39.62 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  42.22 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.96 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  42.04 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 343 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  39.75 
 
 		 345 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.81 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.44 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  41.14 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.9 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  38.7 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.19 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  42.32 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  42.04 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  38.53 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  39.88 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  39.09 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.95 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.85 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  39.25 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  40.63 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  41.85 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  38.23 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  38.75 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  38.23 
 
 		 389 aa  218  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  40.31 
 
 		 343 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 337 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 368 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 343 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  39.32 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  40.84 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  38.56 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>