More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1150 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 253 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.98 
 
 		 253 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.13 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  52.19 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3076  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  52.19 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  51.39 
 
 		 254 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  52.78 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  51.79 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  51 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  51.39 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  51.39 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  51.39 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  51.39 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  51 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  50.6 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.66 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  45.67 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 246 aa  188  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  43.2 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  44.35 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  41.67 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  40.08 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 247 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 249 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  41.83 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5464  short-chain dehydrogenase  44.76 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0590758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0456  short-chain dehydrogenase  45.31 
 
 		 243 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>