More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0986 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.17 
 
 		 435 aa  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0986  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  897    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4446  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  90.34 
 
 		 435 aa  814    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4013  FAD dependent oxidoreductase  71.06 
 
 		 435 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.11 
 
 		 435 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5870  FixC protein  86.67 
 
 		 435 aa  780    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100427  normal  0.798669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3614  FAD dependent oxidoreductase  77.24 
 
 		 435 aa  705    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  94.94 
 
 		 435 aa  841    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0140  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  80.92 
 
 		 435 aa  748    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.942085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  91.95 
 
 		 435 aa  823    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.05 
 
 		 433 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  70.34 
 
 		 435 aa  628  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.05 
 
 		 435 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.29 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.61 
 
 		 436 aa  584  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1194  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.75 
 
 		 432 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0537689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1478  fixC protein  61.75 
 
 		 432 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  61.63 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.26 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.2 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.51 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.43 
 
 		 436 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  48.27 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  49.07 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0958  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.7 
 
 		 437 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1937  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  45.35 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  42.26 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3598  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.88 
 
 		 438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.89 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  40.99 
 
 		 430 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  39.08 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  39.16 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.7 
 
 		 432 aa  289  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.31 
 
 		 431 aa  289  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 430 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  36.96 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  36.96 
 
 		 428 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  36.96 
 
 		 428 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  36.71 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  36.47 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  38.2 
 
 		 429 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  37.38 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  38.2 
 
 		 429 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  37.14 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  37.14 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  37.14 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  37.14 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  37.96 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  37.96 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  37.14 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  37.96 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.96 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  36.89 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  37.96 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2124  hypothetical protein  37.53 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  37.47 
 
 		 429 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  36.82 
 
 		 428 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  36.82 
 
 		 428 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  36.82 
 
 		 428 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  36.82 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  36.82 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08770  flavin-dependent dehydrogenase  36.11 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1843  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  37.75 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.186881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27800  flavin-dependent dehydrogenase  36.5 
 
 		 439 aa  257  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.33 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  36.26 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2198  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00140  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  38.53 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  35.41 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3860  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2906  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.14 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4021  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.14 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3068  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.14 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0648  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.567553  hitchhiker  0.0038978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02611  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  33.78 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0922  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.78 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.713397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02574  hypothetical protein  33.78 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0946  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.78 
 
 		 423 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2895  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.67 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2000  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.59 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3107  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.38 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.916046  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2369  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.66 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  33.59 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0333  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.882916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1249  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1221  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  28.17 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.022805  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1266  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.17 
 
 		 541 aa  137  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.863142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.34 
 
 		 545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>