63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0977 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 		 103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  96.15 
 
 		 104 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  90.38 
 
 		 104 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  86.41 
 
 		 103 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  56.86 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  57.84 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  59.8 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  64.21 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  52 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  61 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  51.46 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.21 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  50.51 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  60 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  52.69 
 
 		 97 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  57.78 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  47.87 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  47.87 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  53.06 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  54.74 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  49.5 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.55 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  54.44 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  46.94 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.44 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.28 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  52.22 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.72 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  41.11 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  45.74 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  41.76 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.94 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  41.76 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  45.74 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  41.41 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  45.36 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  42.05 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.36 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.05 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  33.33 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  37.21 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.21 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  37.21 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  34.52 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.33 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 431 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.37 
 
 		 544 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.1 
 
 		 206 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.49 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.18 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  44.74 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 314 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 1192 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.11 
 
 		 421 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.34 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  30.99 
 
 		 315 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0748  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  28.05 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0663898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  28.4 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  31.71 
 
 		 1190 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>