More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0938 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  95.15 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  81.63 
 
 		 147 aa  245  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 153 aa  95.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  34.75 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  30.83 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.67 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.67 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.67 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.67 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.01 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.01 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.67 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.67 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  28.37 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.93 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  28.07 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.41 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.41 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.41 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0651  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  27.42 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  28.68 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  25.17 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  26.61 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>