More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0909 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  77.67 
 
 		 424 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  100 
 
 		 422 aa  868    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  87.38 
 
 		 422 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  76.36 
 
 		 433 aa  670    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  90.48 
 
 		 422 aa  795    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  76.07 
 
 		 421 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  60 
 
 		 434 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  59.24 
 
 		 434 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  59.37 
 
 		 436 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  59 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  58.77 
 
 		 434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  58.39 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  61.19 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  58.29 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  58.77 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  60.05 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  58.29 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  59.11 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  57.68 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  58.91 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  58.91 
 
 		 886 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  58.91 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  58.91 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  58.91 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  58.91 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  60.49 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  58.91 
 
 		 435 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  58.23 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  58.23 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  55.45 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  55.5 
 
 		 429 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  50.72 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  54.33 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  55.34 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  55.42 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  56.05 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  47.61 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  50.84 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  48.62 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  52.71 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  48.39 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  47.79 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  47.94 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  48.97 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  47.33 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  49.4 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  48.08 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  47.81 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  47.79 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  48.47 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  48.05 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  48.02 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  49.07 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  49.3 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  47.79 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  46.45 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  47.92 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  47.61 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  48.39 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  47 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  49.26 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  47.22 
 
 		 424 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  47.09 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  49.48 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  45.91 
 
 		 413 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  48.71 
 
 		 431 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  47.8 
 
 		 394 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  45.39 
 
 		 438 aa  358  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  47.36 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  45.31 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  46.76 
 
 		 434 aa  355  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  46.84 
 
 		 421 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  45.75 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  48.17 
 
 		 445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  48.95 
 
 		 436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  46.86 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  43.65 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  45.06 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  45.35 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  44.47 
 
 		 462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  46.08 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  46.1 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  45.19 
 
 		 412 aa  342  5.999999999999999e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  46.99 
 
 		 431 aa  342  8e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  46.88 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  44.36 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  42.2 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  42.2 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  43.56 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  41.78 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  45.59 
 
 		 398 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  45.19 
 
 		 391 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  43.02 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  43.84 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  46.32 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  40.83 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  39.68 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  44.1 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  42.4 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  39.8 
 
 		 412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>