23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0839 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  790    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  81.36 
 
 		 397 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  73.3 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  68.01 
 
 		 395 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  61.62 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  60.71 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  61.9 
 
 		 394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  28.64 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  30.56 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  30.81 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  31.91 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  27.41 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  28.66 
 
 		 368 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  27.66 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  26.14 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  24.18 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  25.16 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  25.25 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  24.82 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  27.78 
 
 		 338 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  23.31 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  22.46 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  24.44 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>