50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0836 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  76.67 
 
 		 241 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  71.78 
 
 		 241 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  69.49 
 
 		 240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  68.06 
 
 		 221 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  68.84 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  71.36 
 
 		 238 aa  291  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  48.84 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  47.55 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  46.23 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  48.54 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  46.73 
 
 		 283 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  44.44 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  44.09 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  44.44 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  44.09 
 
 		 300 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  46.51 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  39.51 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  50 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  43.65 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  42.16 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  46.11 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  41.62 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  40.41 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  38.37 
 
 		 195 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  34.83 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  32.79 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  35.11 
 
 		 182 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  37.21 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  39.41 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  37.66 
 
 		 198 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  37.35 
 
 		 177 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  36.42 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  34.03 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  34.48 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  32.64 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  33.1 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  33.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.8 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.83 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.27 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  27.81 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.79 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  23.44 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  27.78 
 
 		 185 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  28.28 
 
 		 190 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>