14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0797 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0797  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  273  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0772  hypothetical protein  52.71 
 
 		 133 aa  137  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000821647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  44.03 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2381  hypothetical protein  42.75 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111754  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2620  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2947  hypothetical protein  43.28 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  38.81 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  29.2 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  30.56 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  27.93 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  27.93 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  27.93 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  26.85 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>