More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0733 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  503  1e-142  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  87.69 
 
 
260 aa  445  1e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  84.25 
 
 
259 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  74.32 
 
 
260 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  68.08 
 
 
260 aa  338  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  67.83 
 
 
260 aa  337  1e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  63.18 
 
 
260 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  56.35 
 
 
260 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  52.76 
 
 
271 aa  216  3e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  47.01 
 
 
266 aa  212  5e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  51.82 
 
 
271 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  45.06 
 
 
259 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  50.2 
 
 
271 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  43.25 
 
 
258 aa  191  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  49.01 
 
 
270 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  48.61 
 
 
260 aa  183  2e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.83 
 
 
405 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 
255 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.32 
 
 
266 aa  179  3e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  46.06 
 
 
251 aa  179  3e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  52.36 
 
 
271 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.32 
 
 
266 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
258 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  40.17 
 
 
257 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 
258 aa  174  1e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
273 aa  172  4e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
273 aa  172  4e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  51.57 
 
 
271 aa  172  4e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  48.76 
 
 
264 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  42.21 
 
 
262 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  35.92 
 
 
253 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
273 aa  172  6e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
255 aa  172  6e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  42.86 
 
 
255 aa  172  6e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  42.86 
 
 
255 aa  172  6e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
255 aa  172  6e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.61 
 
 
273 aa  172  6e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 
255 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  44.54 
 
 
253 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  38.72 
 
 
258 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.09969e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.10402e-05 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  44.73 
 
 
260 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  44.3 
 
 
260 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  39.61 
 
 
252 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  43.33 
 
 
255 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  40.32 
 
 
255 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 
255 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  38.4 
 
 
253 aa  164  1e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
536 aa  164  1e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.42 
 
 
490 aa  162  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.74 
 
 
266 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
259 aa  162  4e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.39 
 
 
424 aa  162  5e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  35.71 
 
 
255 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  37.92 
 
 
254 aa  161  8e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  39.75 
 
 
259 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  36.78 
 
 
424 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
296 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.82 
 
 
409 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  9.791e-05  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  35.25 
 
 
269 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1324  ABC transporter related  44.77 
 
 
250 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  48.23 
 
 
253 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  35.25 
 
 
269 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  44.59 
 
 
255 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  38.49 
 
 
254 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  43.55 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 
250 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 
296 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  42.63 
 
 
250 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 
296 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  40.54 
 
 
271 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  5.06205e-09 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 
296 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 
296 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  33.05 
 
 
271 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.84506e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  38.98 
 
 
269 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  42.86 
 
 
254 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.02 
 
 
266 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3088  ABC transporter related  49.78 
 
 
251 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.33 
 
 
625 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
278 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  40 
 
 
274 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  45.29 
 
 
243 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  40.59 
 
 
255 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.33574e-06  decreased coverage  1.13958e-08 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
255 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.31 
 
 
254 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  37.92 
 
 
274 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  39.33 
 
 
259 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 
265 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  42.62 
 
 
267 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.23 
 
 
260 aa  155  5e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  40.17 
 
 
282 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
253 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  39.13 
 
 
255 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>