115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0706 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  714    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  87.06 
 
 		 371 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  71.82 
 
 		 378 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  74.11 
 
 		 370 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  60.98 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  60.46 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  38.31 
 
 		 361 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  37.71 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  35.28 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  31.78 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  33.17 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  25.73 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.03 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  24.64 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.93 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  28.51 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.51 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  27.15 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  28.05 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.05 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  28.05 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  32.39 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3993  hypothetical protein  29.14 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0182739  normal  0.26526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.3 
 
 		 670 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 189 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  33.1 
 
 		 600 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.3 
 
 		 670 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.3 
 
 		 670 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  29.3 
 
 		 670 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  29.3 
 
 		 670 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  28.92 
 
 		 663 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  28.91 
 
 		 670 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.08 
 
 		 746 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.91 
 
 		 670 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  32.37 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  29.67 
 
 		 730 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  34.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.67 
 
 		 724 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  30.48 
 
 		 724 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  25.63 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  34.25 
 
 		 188 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  26.37 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  29.38 
 
 		 682 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  29.86 
 
 		 704 aa  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  28.37 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  28.37 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  30.71 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  29.29 
 
 		 188 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  29.29 
 
 		 188 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  25.79 
 
 		 690 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.79 
 
 		 690 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  29.86 
 
 		 702 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  34.88 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  25.79 
 
 		 711 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  25.79 
 
 		 690 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  34.88 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  29.29 
 
 		 188 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  27.46 
 
 		 726 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  32.48 
 
 		 635 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  28.37 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  28.37 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  28.37 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  28.37 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  28.37 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  28.87 
 
 		 725 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  29.38 
 
 		 725 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  30.28 
 
 		 184 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.42 
 
 		 720 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  34.06 
 
 		 217 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  32.63 
 
 		 676 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.85 
 
 		 727 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.98 
 
 		 679 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  30.83 
 
 		 679 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  30.05 
 
 		 726 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.85 
 
 		 727 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  30.05 
 
 		 726 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.94 
 
 		 653 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  28.35 
 
 		 725 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.05 
 
 		 745 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  25.43 
 
 		 770 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.05 
 
 		 745 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  28.37 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  30.08 
 
 		 679 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.05 
 
 		 745 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  30.05 
 
 		 745 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  30.05 
 
 		 745 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.05 
 
 		 745 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  29.08 
 
 		 677 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  28.35 
 
 		 725 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  27.27 
 
 		 670 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  30.23 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.31 
 
 		 695 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  30.68 
 
 		 695 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.65 
 
 		 653 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  32.63 
 
 		 673 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  25.66 
 
 		 733 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  31.25 
 
 		 695 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  32.63 
 
 		 673 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>