More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0703 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  92.13 
 
 		 305 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  91.8 
 
 		 305 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  85.25 
 
 		 305 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  84.26 
 
 		 305 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  81.64 
 
 		 306 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  83.28 
 
 		 306 aa  529  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  67.87 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  60.98 
 
 		 312 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  61.31 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  60.33 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  60.33 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  55.56 
 
 		 318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  55.31 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  55.56 
 
 		 306 aa  335  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  54.72 
 
 		 307 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  51.12 
 
 		 313 aa  328  8e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  54.07 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  52.88 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  56.45 
 
 		 294 aa  322  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  53.92 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  52.09 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  52.24 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  50.96 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  54.36 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  52.09 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  52.44 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  53.66 
 
 		 307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  53.82 
 
 		 298 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  53.15 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  52.41 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  50.87 
 
 		 293 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  51.9 
 
 		 291 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  53.31 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  54.86 
 
 		 296 aa  299  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  53.26 
 
 		 290 aa  298  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  51.21 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  51.21 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  51.9 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  51.21 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  51.92 
 
 		 289 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.21 
 
 		 291 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  51.05 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  51.71 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  50.52 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  51.39 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  51.22 
 
 		 289 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  53.17 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  51.04 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  51.05 
 
 		 293 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  51.92 
 
 		 294 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  51.68 
 
 		 304 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.76 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  49.36 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  52.6 
 
 		 293 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  52.6 
 
 		 293 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  52.6 
 
 		 293 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  52.6 
 
 		 293 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 		 293 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  49.48 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  49.83 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  50 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  49.31 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  48.94 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  48.98 
 
 		 291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  48.4 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  48.75 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  49.1 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  48.75 
 
 		 293 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  48.75 
 
 		 293 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  48.75 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  48.97 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  49.31 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  49.48 
 
 		 304 aa  262  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  49.64 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  45.3 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  48.94 
 
 		 296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  48.74 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  48.38 
 
 		 301 aa  255  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  47.92 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  49.83 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  49.48 
 
 		 299 aa  248  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  43.06 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  41.34 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  43.36 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  42.61 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  42.56 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  49.3 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  41.9 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  39.72 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  46.27 
 
 		 254 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  40.65 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  36.92 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  36.33 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  39.64 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  37.63 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  38.25 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  36.56 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>