81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0678 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  92.61 
 
 		 233 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  85.22 
 
 		 233 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  85.27 
 
 		 235 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  80 
 
 		 237 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  77.09 
 
 		 238 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  76.89 
 
 		 231 aa  359  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  59.46 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.89 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.97 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.3 
 
 		 237 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.91 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.88 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.57 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  50.22 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  51.95 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.98 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.64 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.64 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  50.22 
 
 		 234 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.79 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.23 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.79 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.33 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.66 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  44.93 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  42.66 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.05 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.7 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.3 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  41.89 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.89 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  42.79 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.04 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  39.63 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.11 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  37.67 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  39.45 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  41.21 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  40 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.7 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.79 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.43 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  33 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  34.05 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  30 
 
 		 212 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  31.55 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.06 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  29.44 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  34.34 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.35 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.89 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  31.89 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.35 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  28.42 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.27 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.92 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.88 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.88 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  29.35 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  28.89 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  25.52 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  23.76 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  27.14 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.57 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  37.04 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.26 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0493  HAD family hydrolase  31 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0405108  hitchhiker  0.00191213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.91 
 
 		 243 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>