36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0658 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  493  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  82.38 
 
 		 256 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  83.74 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  67.11 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  60.18 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  60.39 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  55.66 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  34.4 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  36.98 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  36.22 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  35.18 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  32.52 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  31.4 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  31.4 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  32.85 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  32.85 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  34.07 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  32.81 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  29.58 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  32.83 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  28.14 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  28.95 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  29.25 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  28.29 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  27.51 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  32.83 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  27.23 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  26.39 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  27.84 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1154  hypothetical protein  26.18 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  26.29 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2773  hypothetical protein  30.83 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2815  hypothetical protein  26.18 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0335  protein of unknown function DUF1239  24.85 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143778  normal  0.315506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  22.27 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  20.9 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>