26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0652 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  89.77 
 
 		 88 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  88.64 
 
 		 88 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  87.5 
 
 		 87 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  86.08 
 
 		 87 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  83.12 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  83.12 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  73.08 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  64.56 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  62.03 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  59.26 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  60.76 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  60.76 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  61.04 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  52.27 
 
 		 88 aa  95.9  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  61.97 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  48.68 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  47.37 
 
 		 85 aa  83.6  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  45.57 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  42.35 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  50.67 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  50.67 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  48 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0189  hypothetical protein  32.18 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.577781  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  34.44 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>