More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0611 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0611  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
281 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0222  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  93.91 
 
 
281 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  84.59 
 
 
282 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  79.26 
 
 
282 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0066  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  79.17 
 
 
266 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  79.03 
 
 
268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0431  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  76.89 
 
 
269 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.93 
 
 
284 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.190208 
 
 
-
 
NC_004310  BR2171  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  76.49 
 
 
272 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2083  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  76.49 
 
 
272 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.464026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  75.28 
 
 
268 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0741  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  76.12 
 
 
272 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.01 
 
 
276 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0868707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.01 
 
 
276 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.28 
 
 
277 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917513  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  74.72 
 
 
282 aa  424  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  75.29 
 
 
264 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  72.26 
 
 
282 aa  424  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.01 
 
 
291 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.185416  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0032  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  73.96 
 
 
277 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.236001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  74.53 
 
 
268 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.43 
 
 
275 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.43 
 
 
275 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26472  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2204  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  73.46 
 
 
262 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1270  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.16 
 
 
272 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.58 
 
 
288 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.75394  hitchhiker  0.000398592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.71 
 
 
272 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.32 
 
 
272 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.71 
 
 
273 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.71 
 
 
272 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.48 
 
 
272 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.32 
 
 
268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.54 
 
 
279 aa  342  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  62.26 
 
 
279 aa  342  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.15 
 
 
279 aa  342  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.09 
 
 
272 aa  341  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61 
 
 
273 aa  341  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.32 
 
 
272 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0051  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  61.07 
 
 
267 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.93 
 
 
272 aa  338  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.55 
 
 
272 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.24 
 
 
282 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2468  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.98 
 
 
277 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4661  enoyl-acyl carrier protein reductase  58.96 
 
 
275 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2476  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.31 
 
 
270 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0264852  normal  0.0112643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4292  enoyl-acyl carrier protein reductase  58.96 
 
 
275 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4810  enoyl-acyl carrier protein reductase  60.38 
 
 
275 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.368185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  60.38 
 
 
286 aa  331  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  60.62 
 
 
275 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.69 
 
 
292 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0657  enoyl-acyl-carrier-protein reductase  57.62 
 
 
275 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.45449  normal  0.282453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.85 
 
 
282 aa  329  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1657  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  59.32 
 
 
262 aa  329  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0857  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.71 
 
 
275 aa  328  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  60.38 
 
 
286 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.16 
 
 
272 aa  326  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.43 
 
 
261 aa  324  1e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.85 
 
 
272 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  57.92 
 
 
280 aa  321  9.000000000000001e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  56.49 
 
 
274 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.65 
 
 
262 aa  317  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4769  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.4 
 
 
267 aa  317  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0134326  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2344  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.07 
 
 
274 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.187833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1019  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.07 
 
 
274 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350664  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.59 
 
 
266 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.92 
 
 
274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61 
 
 
272 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  56.44 
 
 
264 aa  309  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  55.81 
 
 
259 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3934  hypothetical protein  57.79 
 
 
262 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0146062  normal  0.728571 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.41 
 
 
262 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445364  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3176  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  57.41 
 
 
262 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
278 aa  291  9e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  55.04 
 
 
259 aa  290  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.98 
 
 
256 aa  289  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.79 
 
 
262 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  53.36 
 
 
255 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.54 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.94 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0351674  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 
256 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.486877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.37 
 
 
261 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3058  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  53.31 
 
 
272 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
254 aa  271  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
274 aa  271  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  51.18 
 
 
254 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
274 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.84 
 
 
262 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.98 
 
 
260 aa  269  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00175995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2558  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  50.79 
 
 
256 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.646059  hitchhiker  0.0000154465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3620  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  49.81 
 
 
260 aa  268  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000470966  normal  0.0807844 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1426  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.79 
 
 
274 aa  268  7e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1587  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
274 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0818628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
262 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
254 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.02 
 
 
263 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.61 
 
 
272 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  50.39 
 
 
255 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.85 
 
 
263 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>