More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0581 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0581  PfkB  100 
 
 		 333 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  90.39 
 
 		 333 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  88.89 
 
 		 333 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  79.58 
 
 		 333 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  76.13 
 
 		 333 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  80.78 
 
 		 333 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  80.12 
 
 		 333 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  62.65 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  63.14 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  57.93 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  57.93 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  62.24 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  59.39 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  56.23 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  56.12 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  56.12 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  56.97 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  58.79 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  56.72 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  54.27 
 
 		 330 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  52.91 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  55.22 
 
 		 337 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  54.8 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  55.52 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  56.25 
 
 		 407 aa  348  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  52.6 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 330 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  52.58 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  51.34 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  48.94 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  49.85 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  51.98 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  49.54 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  49.24 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  49.38 
 
 		 332 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  52.28 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  52.28 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  52.6 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  41.85 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  37.23 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  39.18 
 
 		 334 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  40.85 
 
 		 335 aa  271  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  37.77 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  38.08 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  40.55 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  43.64 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  41.46 
 
 		 331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  40.67 
 
 		 330 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  40.48 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  43.26 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.99 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  36.72 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.36 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.49 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  34.55 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  36.16 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 327 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  33.97 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  36.59 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  31.64 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  32.82 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  32.51 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.51 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  34.48 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.58 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  28.74 
 
 		 347 aa  96.7  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  31.21 
 
 		 304 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.13 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.94 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.08 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  30.99 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  30.67 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  31.74 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  30.29 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.21 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  27.14 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.53 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  28.98 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.11 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  27.52 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  29.78 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  28.61 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  28.13 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  30.58 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.68 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  27.22 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.08 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  27.01 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  29.32 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.08 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.1 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.7 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>