More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0528 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  61.2 
 
 		 916 aa  1006    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  59.06 
 
 		 908 aa  961    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 		 820 aa  713    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  61.17 
 
 		 915 aa  990    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  59.74 
 
 		 962 aa  952    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  60.18 
 
 		 910 aa  1021    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  48.43 
 
 		 873 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  59.8 
 
 		 883 aa  1015    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  60.18 
 
 		 898 aa  1022    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  48.26 
 
 		 882 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  55.51 
 
 		 914 aa  971    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  44.31 
 
 		 804 aa  716    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  81.42 
 
 		 888 aa  1409    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  57.56 
 
 		 875 aa  908    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  57.19 
 
 		 877 aa  889    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  57.56 
 
 		 880 aa  908    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  50.66 
 
 		 904 aa  752    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  57.37 
 
 		 876 aa  896    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  82.51 
 
 		 910 aa  1456    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  57.92 
 
 		 929 aa  905    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  60.6 
 
 		 925 aa  954    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 911 aa  1818    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  49.32 
 
 		 858 aa  742    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  44.36 
 
 		 804 aa  709    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  55.01 
 
 		 877 aa  880    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  62.38 
 
 		 921 aa  1034    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  59.71 
 
 		 910 aa  1022    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  87.63 
 
 		 882 aa  1550    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  61.22 
 
 		 905 aa  931    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  91.93 
 
 		 907 aa  1620    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  92.07 
 
 		 923 aa  1645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  82.93 
 
 		 907 aa  1483    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  56.16 
 
 		 879 aa  900    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  49.72 
 
 		 864 aa  731    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  60.07 
 
 		 880 aa  1013    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  56.94 
 
 		 878 aa  900    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  57.89 
 
 		 919 aa  947    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  61.41 
 
 		 881 aa  1028    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  61.31 
 
 		 896 aa  1004    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  54.02 
 
 		 897 aa  853    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  61.47 
 
 		 929 aa  952    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  61.53 
 
 		 916 aa  1009    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  52.58 
 
 		 904 aa  818    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  60.67 
 
 		 908 aa  1028    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.11 
 
 		 871 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 868 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  44.86 
 
 		 872 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.19 
 
 		 872 aa  625  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 870 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 		 869 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 		 870 aa  615  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 815 aa  615  9.999999999999999e-175  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 891 aa  613  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  43.03 
 
 		 898 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 		 870 aa  601  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 873 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  38.38 
 
 		 869 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 		 900 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  37.25 
 
 		 868 aa  596  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.2 
 
 		 859 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 859 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  43.06 
 
 		 897 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 932 aa  595  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 881 aa  589  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 		 862 aa  591  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 892 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 		 896 aa  588  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 863 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.84 
 
 		 858 aa  586  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 872 aa  588  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 853 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.52 
 
 		 863 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 		 938 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 859 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 861 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 861 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 		 861 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 		 894 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  0.000000391787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 861 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 939 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 855 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 891 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 855 aa  581  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 860 aa  582  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 		 939 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 939 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.54 
 
 		 856 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 893 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.97 
 
 		 884 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.97 
 
 		 884 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 		 862 aa  579  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  37.86 
 
 		 887 aa  581  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 882 aa  581  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 939 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 856 aa  578  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 		 853 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 889 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>