More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0526 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.68 
 
 		 281 aa  329  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  58.67 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  60.73 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  59.11 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  46.72 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  45.99 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  45.59 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  44.24 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.85 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 		 276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  42.24 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  43.27 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 		 281 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  40.81 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  37.32 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  40.29 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  40.29 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  40.29 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 279 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  38.18 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  38.24 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  41.04 
 
 		 847 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  38.6 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  41.87 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>