43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0504 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  100 
 
 		 351 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  86.32 
 
 		 350 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  86.89 
 
 		 351 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  71.75 
 
 		 352 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  69.52 
 
 		 350 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  70.57 
 
 		 370 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  68.38 
 
 		 348 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  49.31 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  47.99 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  47.84 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  49.39 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  51.58 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  46.63 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  48.35 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  47.24 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  37.61 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  39.53 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  26.82 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  29.26 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  28.52 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  28.92 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  30.36 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  27.51 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  29.12 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  27.81 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  25.31 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  25.7 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  25.19 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  25.56 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  25.56 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  28.93 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  28.93 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  25.06 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  28.93 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  28.3 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  28.3 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  28.93 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  29.11 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  29.11 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  27.67 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  26.25 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  25.59 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  26.39 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>