More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0217 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0217  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  100 
 
 
347 aa  717    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0604  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  91.93 
 
 
347 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5041  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  87.9 
 
 
347 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0775  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  59.03 
 
 
347 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0154  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  59.09 
 
 
347 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000490332  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3373  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  58.45 
 
 
347 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0161  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  59.09 
 
 
347 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000034815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3408  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  55.97 
 
 
346 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.163822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0153  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  59.09 
 
 
347 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1044  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  58.45 
 
 
347 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0547285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3501  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  58.45 
 
 
347 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0580253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0155  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  59.09 
 
 
347 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00144171  normal  0.0933514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0158  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  59.09 
 
 
347 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0649  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  58.29 
 
 
347 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.453768  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00104  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.67 
 
 
347 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3497  guanosine monophosphate reductase  57.95 
 
 
347 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00103  hypothetical protein  57.67 
 
 
347 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0663  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.88 
 
 
346 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0106  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.67 
 
 
347 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0097  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.67 
 
 
347 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000247841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3578  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.43 
 
 
346 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0109  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.95 
 
 
347 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000081181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0111  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.95 
 
 
347 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000028675  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3765  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.43 
 
 
346 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3554  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.95 
 
 
347 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169079 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06224  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  54.7 
 
 
347 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000471  GMP reductase  54.99 
 
 
347 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1080  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  55.27 
 
 
347 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0108  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.67 
 
 
347 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0501  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  54.13 
 
 
347 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0639635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0096  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  56.45 
 
 
345 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4233  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  53.28 
 
 
347 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0078  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  56.73 
 
 
345 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.76224e-28 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0624  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  56 
 
 
346 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0602959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1029  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  47.53 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  37.57 
 
 
374 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  36.72 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1766  IMP dehydrogenase/GMP reductase  36.72 
 
 
369 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2902  hypothetical protein  33.64 
 
 
337 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2755  hypothetical protein  33.64 
 
 
337 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  31.61 
 
 
373 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  32.31 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  31.89 
 
 
484 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.59 
 
 
485 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.24 
 
 
508 aa  162  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
485 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  38.98 
 
 
486 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.77 
 
 
486 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
380 aa  159  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  37.66 
 
 
484 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1087  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  29.77 
 
 
327 aa  158  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.55 
 
 
483 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.16 
 
 
493 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0389  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  29.15 
 
 
330 aa  155  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000244366  hitchhiker  0.0000000000000331552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.5 
 
 
488 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1064  GMP reductase  37.39 
 
 
349 aa  155  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.361476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.23 
 
 
482 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.23 
 
 
482 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.56 
 
 
485 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0068  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  30.7 
 
 
324 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000829344  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  31.74 
 
 
357 aa  153  4e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
486 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.65 
 
 
556 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1425  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  29.19 
 
 
325 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1398  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  29.19 
 
 
325 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000185799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.59 
 
 
488 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.21 
 
 
487 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0906  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  29.74 
 
 
325 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1256  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  30.35 
 
 
329 aa  152  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.244091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.21 
 
 
497 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.66 
 
 
489 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.27 
 
 
487 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.74 
 
 
485 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.82 
 
 
487 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.27 
 
 
487 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.64 
 
 
485 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.74 
 
 
485 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.85 
 
 
487 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.73 
 
 
482 aa  150  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.86 
 
 
487 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.85 
 
 
487 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.41 
 
 
487 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.91 
 
 
487 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.68 
 
 
491 aa  149  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.59 
 
 
485 aa  150  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.43 
 
 
485 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.91 
 
 
487 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.91 
 
 
487 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.27 
 
 
483 aa  149  8e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.91 
 
 
487 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.45 
 
 
486 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.29 
 
 
496 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  31.78 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.35 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.97 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  41.26 
 
 
479 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.93 
 
 
490 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.46 
 
 
486 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.93 
 
 
488 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.87 
 
 
483 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>