43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0159 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  487  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  72.94 
 
 		 253 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  50.22 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  44.81 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  43.14 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  39.42 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3889  hypothetical protein  41.44 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31119  normal  0.156158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  38.36 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  35.59 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  36.58 
 
 		 318 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  32.68 
 
 		 300 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  35.46 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  35.87 
 
 		 322 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  32.78 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  34.25 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.12 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  28.17 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  34.86 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  39.33 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  31.41 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.98 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  28.88 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  32.78 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  35.29 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  31.79 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  32.28 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  32.78 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  26.21 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  26.06 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.89 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  30 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  33.05 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  32.06 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  28.12 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  32.06 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>