More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0106 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
178 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  96.05 
 
 
178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0415  inorganic pyrophosphatase  90.96 
 
 
178 aa  339  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0268  inorganic pyrophosphatase  85.39 
 
 
178 aa  323  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  86.86 
 
 
176 aa  320  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  86.36 
 
 
176 aa  319  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  83.15 
 
 
180 aa  311  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  84.88 
 
 
181 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  80 
 
 
177 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  79.66 
 
 
178 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  76.84 
 
 
177 aa  298  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.297464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  78.53 
 
 
179 aa  297  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  78.53 
 
 
179 aa  297  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  76.84 
 
 
177 aa  295  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  78.53 
 
 
181 aa  295  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  73.6 
 
 
179 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  72.88 
 
 
178 aa  277  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  72.32 
 
 
199 aa  277  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  73.03 
 
 
178 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  73.56 
 
 
177 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  71.84 
 
 
177 aa  269  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  72.57 
 
 
176 aa  266  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  72 
 
 
176 aa  266  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  72 
 
 
176 aa  266  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  62.5 
 
 
176 aa  236  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  61.14 
 
 
175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0329  inorganic pyrophosphatase  62.15 
 
 
177 aa  231  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  60.34 
 
 
178 aa  227  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0292  inorganic diphosphatase  59.32 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2532  inorganic diphosphatase  58.19 
 
 
179 aa  217  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0146  inorganic pyrophosphatase  58.43 
 
 
179 aa  215  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  55.06 
 
 
178 aa  209  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0029  inorganic pyrophosphatase  56.4 
 
 
177 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360391  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  55.17 
 
 
175 aa  207  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  55.75 
 
 
175 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  56.9 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
176 aa  204  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
176 aa  204  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  56.9 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  56.9 
 
 
176 aa  204  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  52.81 
 
 
182 aa  203  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  53.71 
 
 
175 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  55.17 
 
 
176 aa  203  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  56.74 
 
 
176 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  58.05 
 
 
176 aa  201  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  55.17 
 
 
175 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  55.17 
 
 
175 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  55.17 
 
 
175 aa  201  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  57.47 
 
 
176 aa  201  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  55.43 
 
 
175 aa  201  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 
176 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 
176 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  54.29 
 
 
176 aa  201  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 
176 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 
176 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 
176 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  55.88 
 
 
175 aa  201  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  52.25 
 
 
182 aa  200  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  55.68 
 
 
175 aa  200  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  54.29 
 
 
177 aa  198  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  53.37 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  57.23 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  55.29 
 
 
175 aa  197  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  54.02 
 
 
175 aa  197  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  54.02 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  53.41 
 
 
206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  54.6 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  54.65 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0590  inorganic pyrophosphatase  54.02 
 
 
175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0538  inorganic pyrophosphatase  54.02 
 
 
175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  52.81 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2005  inorganic diphosphatase  53.49 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0775435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  52.54 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0583  inorganic pyrophosphatase  54.02 
 
 
175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0577  inorganic pyrophosphatase  54.02 
 
 
175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.255065  normal  0.754426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  55.29 
 
 
181 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  55.29 
 
 
181 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  54.71 
 
 
175 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  54.71 
 
 
175 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0624  inorganic pyrophosphatase  53.45 
 
 
175 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2281  inorganic diphosphatase  55.68 
 
 
176 aa  194  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.575051  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  50.85 
 
 
182 aa  194  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 
176 aa  194  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  52.57 
 
 
176 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  51.4 
 
 
179 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  52.84 
 
 
176 aa  192  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4996  inorganic pyrophosphatase  52.3 
 
 
175 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1975  Inorganic diphosphatase  51.98 
 
 
178 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  52.91 
 
 
178 aa  191  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  51.45 
 
 
174 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  51.12 
 
 
178 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  51.14 
 
 
176 aa  188  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  51.14 
 
 
186 aa  188  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0608  inorganic pyrophosphatase  52.57 
 
 
177 aa  187  9e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0773758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  51.15 
 
 
175 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>