226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0089 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  91.68 
 
 
589 aa  1081  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  79.21 
 
 
582 aa  928  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  89.93 
 
 
585 aa  1030  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  100 
 
 
584 aa  1166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  54.69 
 
 
580 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  51.79 
 
 
584 aa  577  1e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  50.77 
 
 
581 aa  572  1e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  49.05 
 
 
581 aa  571  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  50.6 
 
 
581 aa  568  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  53.6 
 
 
609 aa  568  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  51.02 
 
 
584 aa  563  1e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  50.34 
 
 
584 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  43.53 
 
 
671 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  40.77 
 
 
575 aa  343  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  39.75 
 
 
575 aa  335  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  39.17 
 
 
585 aa  323  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  39.17 
 
 
585 aa  323  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  32.21 
 
 
663 aa  270  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  36.17 
 
 
689 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  34.15 
 
 
464 aa  186  1e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  31.83 
 
 
467 aa  185  2e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  33.95 
 
 
464 aa  184  4e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  33.71 
 
 
478 aa  181  3e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  34.5 
 
 
467 aa  180  6e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  34.5 
 
 
467 aa  180  6e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  34.29 
 
 
467 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  34.29 
 
 
467 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  34.29 
 
 
467 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  34.29 
 
 
467 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  34.29 
 
 
467 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  33.95 
 
 
466 aa  177  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  33.47 
 
 
467 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  32.6 
 
 
463 aa  175  2e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  31.75 
 
 
518 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
498 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  31.85 
 
 
501 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
498 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
498 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  35.65 
 
 
541 aa  170  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  33.04 
 
 
455 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.39 
 
 
434 aa  166  1e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  29.8 
 
 
485 aa  165  2e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
498 aa  165  2e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.39 
 
 
434 aa  165  2e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  29.55 
 
 
505 aa  165  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  31.85 
 
 
498 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
498 aa  164  4e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  29.69 
 
 
485 aa  164  5e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  32.65 
 
 
557 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  29.92 
 
 
486 aa  163  8e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  31.55 
 
 
545 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  31.55 
 
 
545 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  31.55 
 
 
545 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  31.55 
 
 
545 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  32.04 
 
 
468 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  33.6 
 
 
476 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  33.6 
 
 
509 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  32.52 
 
 
471 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  33.6 
 
 
479 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  33.4 
 
 
480 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  33.4 
 
 
478 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  32.65 
 
 
501 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  31.42 
 
 
546 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  31.42 
 
 
546 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  33.6 
 
 
476 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  33.6 
 
 
476 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  33.06 
 
 
577 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  31.55 
 
 
546 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
543 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  6.19726e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  40.49 
 
 
426 aa  154  3e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  30.02 
 
 
496 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  3.12808e-05 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  29.4 
 
 
548 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  30.62 
 
 
548 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  29.82 
 
 
527 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  29.55 
 
 
496 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  33.92 
 
 
470 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  28.78 
 
 
557 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  30.1 
 
 
502 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  36.61 
 
 
525 aa  151  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  28.91 
 
 
545 aa  150  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  29.85 
 
 
557 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  29.85 
 
 
557 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  30.34 
 
 
483 aa  149  1e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  29.34 
 
 
543 aa  149  2e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  34 
 
 
481 aa  147  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  28.96 
 
 
450 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  30.28 
 
 
553 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  34.26 
 
 
547 aa  145  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  29.51 
 
 
557 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  33.15 
 
 
471 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  33.43 
 
 
471 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  33.8 
 
 
454 aa  144  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  33.43 
 
 
471 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
471 aa  144  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  28.36 
 
 
557 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  32.96 
 
 
471 aa  143  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  29.72 
 
 
557 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.86968e-12 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  33.15 
 
 
471 aa  143  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  32.68 
 
 
471 aa  142  1e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  33.71 
 
 
476 aa  142  1e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>