26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0087 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  75.34 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0716  hypothetical protein  84.93 
 
 		 73 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  53.95 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  56.67 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  55.74 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0326  hypothetical protein  68.42 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469377  normal  0.154186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0026  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0588676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  60 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  65.52 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.465275 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  66.07 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0198  hypothetical protein  84.62 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.24053  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0155  hypothetical protein  74.19 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3578  hypothetical protein  43.84 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  53.57 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  50 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  58.97 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  73.08 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  49.09 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2962  hypothetical protein  52.46 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671489  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  49.12 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1328  hypothetical protein  76 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5219  protein of unknown function DUF1674  50.79 
 
 		 68 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  69.23 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  45.61 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  72 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>