More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0082 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  70.88 
 
 
584 aa  797  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  82.01 
 
 
577 aa  963  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  87.21 
 
 
594 aa  1034  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
594 aa  1179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  72.98 
 
 
589 aa  766  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  72.56 
 
 
586 aa  810  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  73.64 
 
 
581 aa  806  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  60.75 
 
 
586 aa  611  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  60.49 
 
 
583 aa  606  1e-172  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  55.64 
 
 
583 aa  603  1e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.29294e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  58.27 
 
 
580 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  59.04 
 
 
610 aa  594  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  53.97 
 
 
590 aa  589  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  51.64 
 
 
581 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  54.09 
 
 
582 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  52.26 
 
 
599 aa  591  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  54.09 
 
 
645 aa  588  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  54.66 
 
 
617 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  53.79 
 
 
579 aa  583  1e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  58.18 
 
 
633 aa  584  1e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  54.09 
 
 
576 aa  582  1e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  53.16 
 
 
645 aa  583  1e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  57.76 
 
 
606 aa  583  1e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  56.3 
 
 
576 aa  579  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  53.79 
 
 
579 aa  576  1e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  53.97 
 
 
579 aa  577  1e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  53.79 
 
 
579 aa  576  1e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  53.97 
 
 
579 aa  577  1e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  53.6 
 
 
579 aa  573  1e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  53.79 
 
 
579 aa  573  1e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  53.79 
 
 
579 aa  573  1e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  57.81 
 
 
596 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3633  gamma-glutamyltransferase  55.44 
 
 
589 aa  562  1e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  52.5 
 
 
579 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  52.31 
 
 
583 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  52.24 
 
 
576 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  51.85 
 
 
581 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  52.25 
 
 
581 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  52.04 
 
 
580 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  51.81 
 
 
586 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  52.04 
 
 
580 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  52.04 
 
 
577 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  51.67 
 
 
581 aa  534  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  51.85 
 
 
580 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  51.67 
 
 
580 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  51.67 
 
 
581 aa  534  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  51.85 
 
 
580 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  50.93 
 
 
580 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  51.87 
 
 
589 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  50.74 
 
 
580 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  50.64 
 
 
580 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  51.6 
 
 
606 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  50.64 
 
 
580 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  50.83 
 
 
580 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  48.88 
 
 
619 aa  506  1e-142  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  49.9 
 
 
556 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  49.71 
 
 
556 aa  498  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  51.65 
 
 
587 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  49.36 
 
 
586 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  49.63 
 
 
587 aa  485  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  50.96 
 
 
592 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  50 
 
 
587 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  49.27 
 
 
576 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  49.27 
 
 
576 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  49.62 
 
 
587 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  50.29 
 
 
597 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  48.4 
 
 
583 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  50.3 
 
 
579 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 
578 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  47.37 
 
 
583 aa  469  1e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  48.64 
 
 
588 aa  471  1e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  49.46 
 
 
575 aa  469  1e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  50.29 
 
 
587 aa  470  1e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  50.27 
 
 
574 aa  466  1e-130  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  50.2 
 
 
583 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  50.2 
 
 
583 aa  468  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  50.2 
 
 
583 aa  468  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  48.91 
 
 
575 aa  466  1e-130  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  49.4 
 
 
578 aa  466  1e-130  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  49.61 
 
 
587 aa  467  1e-130  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  47.01 
 
 
583 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  49.18 
 
 
578 aa  465  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  47.87 
 
 
575 aa  460  1e-128  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  47.91 
 
 
579 aa  462  1e-128  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  49.4 
 
 
578 aa  460  1e-128  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  44.74 
 
 
599 aa  453  1e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  45.08 
 
 
604 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  47.3 
 
 
583 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  44.88 
 
 
593 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1522  gamma-glutamyltransferase  50.3 
 
 
589 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  42.46 
 
 
566 aa  417  1e-115  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  44.59 
 
 
590 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2907  gamma-glutamyltransferase  49.2 
 
 
617 aa  400  1e-110  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64422  normal  0.111348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  44.76 
 
 
617 aa  399  1e-110  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  42.96 
 
 
571 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  42.07 
 
 
560 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  42.18 
 
 
573 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  42.18 
 
 
573 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  42.18 
 
 
573 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  41.51 
 
 
577 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>