More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0058 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
274 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  95.6 
 
 
274 aa  547  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  95.26 
 
 
274 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  89.01 
 
 
273 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  84.93 
 
 
274 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  84.62 
 
 
274 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  86.3 
 
 
271 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  70.44 
 
 
275 aa  424  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  70.74 
 
 
274 aa  415  1e-115  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  70.96 
 
 
277 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  70.22 
 
 
277 aa  411  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  67.41 
 
 
275 aa  398  1e-110  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  68.86 
 
 
279 aa  399  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  67.16 
 
 
275 aa  400  1e-110  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  67.16 
 
 
299 aa  399  1e-110  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  66.42 
 
 
278 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  66.42 
 
 
278 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  67.04 
 
 
278 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  68.01 
 
 
273 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  65.54 
 
 
276 aa  381  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  62.92 
 
 
279 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  65.44 
 
 
283 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  65.3 
 
 
279 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  63.14 
 
 
276 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  1.66393e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  63.37 
 
 
279 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  65.08 
 
 
274 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  61.25 
 
 
274 aa  360  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 
263 aa  360  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  64.68 
 
 
274 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  62.93 
 
 
279 aa  357  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  60.37 
 
 
275 aa  355  6e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  62.16 
 
 
284 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  61.39 
 
 
284 aa  350  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  60.97 
 
 
276 aa  342  6e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  60.53 
 
 
271 aa  341  8e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  61.83 
 
 
271 aa  338  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  58.3 
 
 
293 aa  336  2e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  58.3 
 
 
293 aa  336  2e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  59.11 
 
 
293 aa  336  2e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  60.69 
 
 
269 aa  331  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  60.71 
 
 
261 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  58.98 
 
 
271 aa  327  2e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  52.96 
 
 
259 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 
259 aa  289  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  56.72 
 
 
258 aa  288  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  54.77 
 
 
258 aa  286  3e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  53.31 
 
 
266 aa  285  5e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  53.08 
 
 
260 aa  282  4e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  53.14 
 
 
255 aa  281  6e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  52.48 
 
 
258 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
272 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
272 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
272 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
272 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
272 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
272 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
273 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  52.71 
 
 
266 aa  278  8e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  52.67 
 
 
267 aa  275  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  54.09 
 
 
275 aa  274  1e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 
268 aa  274  1e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 
268 aa  273  2e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  49.43 
 
 
275 aa  273  2e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 
268 aa  273  2e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  50.99 
 
 
263 aa  273  2e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  51.55 
 
 
262 aa  273  3e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
260 aa  272  4e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
268 aa  272  5e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  52.97 
 
 
261 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 
260 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 
260 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  52.54 
 
 
261 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 
260 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 
260 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 
260 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  54.55 
 
 
267 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  52 
 
 
284 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  50.75 
 
 
274 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  50.61 
 
 
268 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  51.01 
 
 
268 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  52.65 
 
 
261 aa  269  3e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 
263 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  51.98 
 
 
277 aa  268  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  51.39 
 
 
270 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  52.63 
 
 
260 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  52.83 
 
 
284 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
256 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  52.74 
 
 
258 aa  266  3e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
260 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
265 aa  265  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  52.74 
 
 
270 aa  265  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  51.85 
 
 
274 aa  265  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
268 aa  265  6e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  51.33 
 
 
271 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  51.33 
 
 
271 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  54.42 
 
 
260 aa  264  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  51 
 
 
267 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  7.31877e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  54.17 
 
 
256 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  50.57 
 
 
271 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  48.85 
 
 
269 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>