13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0049 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0049  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0160  hypothetical protein  86.84 
 
 
314 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199424  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0034  hypothetical protein  85.41 
 
 
294 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  83.27 
 
 
326 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0442  hypothetical protein  81.75 
 
 
315 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0070  hypothetical protein  79.65 
 
 
311 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0062  hypothetical protein  78.42 
 
 
334 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.854831  normal  0.19763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2687  hypothetical protein  52.68 
 
 
251 aa  225  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0088  hypothetical protein  48.76 
 
 
264 aa  213  4e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3559  hypothetical protein  40.78 
 
 
353 aa  174  2e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0016  hypothetical protein  25.32 
 
 
165 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.120709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  26.56 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0238  hypothetical protein  23.46 
 
 
195 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>