24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0042 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  275  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0167  hypothetical protein  79.72 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0450  hypothetical protein  66.07 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0217  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0702  hypothetical protein  33.06 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1692  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4346  hypothetical protein  37.01 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1776  hypothetical protein  40.22 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1792  hypothetical protein  39.13 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.000000000573078  normal  0.10017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1324  putative exported protein of unknown function  38.24 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903845  normal  0.229957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2666  hypothetical protein  38.4 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2389  hypothetical protein  38.4 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1012  hypothetical protein  40.38 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.12519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0760  hypothetical protein  40.59 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2346  hypothetical protein  37.27 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3136  hypothetical protein  37.82 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0218  hypothetical protein  38.4 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0439121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4462  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0363  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0838  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4730  hypothetical protein  34.04 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6223  hypothetical protein  34.75 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.200411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5426  hypothetical protein  34.34 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>