26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0036 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  290  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  87.32 
 
 
142 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  88.65 
 
 
142 aa  259  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  81.29 
 
 
142 aa  236  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  56.82 
 
 
146 aa  151  3e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  43.94 
 
 
158 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  37.41 
 
 
142 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.19394e-05  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  40.48 
 
 
134 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  42.31 
 
 
134 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  42.98 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  35.66 
 
 
174 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  38.81 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  38.28 
 
 
138 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  34.11 
 
 
124 aa  81.6  3e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  36.76 
 
 
172 aa  81.3  4e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  39.22 
 
 
155 aa  78.2  3e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  34.35 
 
 
131 aa  74.7  4e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  35.94 
 
 
146 aa  73.2  1e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  36.21 
 
 
142 aa  71.2  5e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  34.51 
 
 
137 aa  68.2  4e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  66.2  1e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  32.77 
 
 
144 aa  66.2  1e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  34.96 
 
 
140 aa  59.3  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  59.3  2e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  34.29 
 
 
164 aa  54.3  5e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00390  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
287 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>