75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0031 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  100 
 
 
169 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  82.25 
 
 
169 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  79.29 
 
 
169 aa  253  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  78.11 
 
 
170 aa  251  5e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  73.96 
 
 
169 aa  245  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  67.86 
 
 
168 aa  238  3e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  67.26 
 
 
169 aa  233  1e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  65.48 
 
 
169 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  64.88 
 
 
169 aa  228  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  66.67 
 
 
169 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  64.29 
 
 
169 aa  226  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  66.06 
 
 
169 aa  226  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  62.05 
 
 
169 aa  198  2e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  58.43 
 
 
169 aa  190  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.02537e-05  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  57.5 
 
 
168 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  51.83 
 
 
167 aa  170  7e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  53.7 
 
 
167 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  46.34 
 
 
167 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  47.85 
 
 
167 aa  134  6e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  43.37 
 
 
168 aa  125  2e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  40.85 
 
 
153 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  29.73 
 
 
145 aa  69.3  2e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  35.35 
 
 
189 aa  67.4  8e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  33.33 
 
 
202 aa  64.7  6e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  34.07 
 
 
148 aa  64.3  7e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  33.66 
 
 
202 aa  62.8  2e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  34 
 
 
186 aa  62.8  2e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  32.99 
 
 
181 aa  59.3  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  29.63 
 
 
172 aa  59.3  3e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  31.31 
 
 
199 aa  58.9  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  32.63 
 
 
181 aa  57  1e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  34.65 
 
 
187 aa  57  1e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.71 
 
 
145 aa  54.7  7e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  30.23 
 
 
185 aa  54.3  8e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  31.78 
 
 
147 aa  54.3  8e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.59 
 
 
182 aa  52.4  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  27.47 
 
 
177 aa  51.6  6e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  29.7 
 
 
193 aa  50.8  9e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  27.93 
 
 
171 aa  48.9  4e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  32.32 
 
 
182 aa  48.1  5e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  31.25 
 
 
186 aa  48.5  5e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  31.63 
 
 
144 aa  48.1  6e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  29.7 
 
 
182 aa  47.8  7e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  29.7 
 
 
182 aa  47.4  8e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  27.52 
 
 
159 aa  47.8  8e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  28.32 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  28.87 
 
 
170 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  30.1 
 
 
185 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  32.04 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  27 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  31.58 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  28.66 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  27.72 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  27.84 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  28 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  29.47 
 
 
183 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  29.47 
 
 
183 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  24.24 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  33.8 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  25.25 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  25.25 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  27.37 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  26.47 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  31.68 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  24.24 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  24.24 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3583  OsmC family protein  28.83 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  24.06 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  24.24 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  29.37 
 
 
134 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  30.39 
 
 
163 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  27.45 
 
 
187 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  22.22 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  27.55 
 
 
208 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>