More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0029 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  96.24 
 
 		 133 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  94.74 
 
 		 133 aa  257  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  82.09 
 
 		 150 aa  227  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  81.4 
 
 		 129 aa  221  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  82.58 
 
 		 133 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  82.26 
 
 		 136 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  72.79 
 
 		 138 aa  204  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  77.27 
 
 		 133 aa  203  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  74.24 
 
 		 132 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  74.24 
 
 		 132 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  74.24 
 
 		 132 aa  200  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  71.21 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  72.18 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  68.66 
 
 		 138 aa  193  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  71.76 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  71.76 
 
 		 142 aa  193  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  68.89 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  68.89 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  77.5 
 
 		 135 aa  188  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  71.54 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  74.26 
 
 		 138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  66.92 
 
 		 151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  75.21 
 
 		 138 aa  186  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  71.09 
 
 		 128 aa  186  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  68.7 
 
 		 135 aa  186  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  68.94 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  67.44 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  67.69 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  66.41 
 
 		 347 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  75 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  75 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  66.91 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  73.5 
 
 		 138 aa  180  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  74.36 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 		 334 aa  166  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  56.92 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  59.5 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  59.84 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  47.2 
 
 		 315 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  48 
 
 		 313 aa  105  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.6 
 
 		 315 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  43.61 
 
 		 318 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  43.59 
 
 		 317 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.35 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.93 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  39.26 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  38.93 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  39.26 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  39.26 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  42.4 
 
 		 314 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  38.81 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  44.44 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  43.2 
 
 		 316 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  43.59 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  42.4 
 
 		 313 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  44.26 
 
 		 319 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  40 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.4 
 
 		 316 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  43.33 
 
 		 314 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  42.37 
 
 		 302 aa  93.6  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  44 
 
 		 314 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  35.94 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44 
 
 		 314 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  39.37 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  43.2 
 
 		 314 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  40 
 
 		 400 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.46 
 
 		 321 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  41.18 
 
 		 329 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  43.2 
 
 		 314 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  41.86 
 
 		 320 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  38.81 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.8 
 
 		 317 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  36.59 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  38.06 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  38.06 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  38.06 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  42.5 
 
 		 306 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  43.33 
 
 		 312 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  38.06 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  41.86 
 
 		 320 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.02 
 
 		 363 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>