More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5135 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  98.77 
 
 
81 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  93.83 
 
 
81 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  85.19 
 
 
81 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  83.95 
 
 
81 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  86.42 
 
 
81 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  85.19 
 
 
81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  67.61 
 
 
97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 
85 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  59.26 
 
 
82 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 
69 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  60.53 
 
 
110 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  51.9 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  57.69 
 
 
78 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  66.67 
 
 
86 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  51.85 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  60.29 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  63.77 
 
 
99 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  56.76 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  56.58 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
85 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 
89 aa  92  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  63.08 
 
 
70 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  57.53 
 
 
82 aa  90.1  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  55.13 
 
 
79 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  55.13 
 
 
79 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  52.7 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
130 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  53.62 
 
 
77 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  55.07 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  52.17 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  55.07 
 
 
86 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  50.67 
 
 
76 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  52.24 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 
83 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  57.97 
 
 
70 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  49.25 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.21 
 
 
77 aa  87.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  60.94 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  57.97 
 
 
105 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  56.52 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  47.14 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  57.97 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  59.7 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  53.16 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  47.44 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  50.67 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  50.67 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  54.55 
 
 
73 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  52 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  50.67 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  49.28 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  55.07 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  56.25 
 
 
64 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  49.33 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  44.87 
 
 
78 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  49.33 
 
 
76 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  54.93 
 
 
81 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  43.59 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  62.9 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  44.87 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  44.87 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  44.87 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.38 
 
 
122 aa  84.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  55.07 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  48.72 
 
 
82 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  43.59 
 
 
78 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  43.59 
 
 
78 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  60.94 
 
 
100 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  43.59 
 
 
78 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  43.59 
 
 
78 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  46.91 
 
 
88 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  46.91 
 
 
88 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  57.35 
 
 
69 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  57.35 
 
 
69 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  43.59 
 
 
78 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  46.91 
 
 
88 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
85 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2236  hypothetical protein  57.58 
 
 
71 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  50.72 
 
 
68 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  53.42 
 
 
79 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  52.17 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  54.69 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  50.72 
 
 
70 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  46.91 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  46.91 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>