More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5033 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5321  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  82.6 
 
 
435 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  82.64 
 
 
435 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.825444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  82.6 
 
 
435 aa  715    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5478  phosphate regulon sensor protein phoR  95 
 
 
440 aa  831    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  82.83 
 
 
435 aa  718    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26034  normal  0.358942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5033  PAS:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  100 
 
 
440 aa  901    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5607  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  84.72 
 
 
440 aa  717    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4407  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  77.91 
 
 
439 aa  666    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.146321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70760  two-component sensor PhoR  77.31 
 
 
443 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6139  two-component sensor PhoR  78.01 
 
 
439 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  68.37 
 
 
440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.73 
 
 
440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.48 
 
 
439 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4401  histidine kinase  48.24 
 
 
447 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  48.14 
 
 
434 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  46.21 
 
 
446 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  45.58 
 
 
433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  45.82 
 
 
437 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0254  phosphate regulon sensor protein  45.27 
 
 
433 aa  338  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01027  phosphate regulon sensor protein  45 
 
 
432 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  44.36 
 
 
436 aa  332  9e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
431 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2456  phosphate regulon sensor protein  45.17 
 
 
432 aa  329  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 
432 aa  329  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  43.51 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.15 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 
443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 
440 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004384  phosphate regulon sensor protein phoR  46.29 
 
 
402 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
432 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
432 aa  323  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  44.44 
 
 
432 aa  322  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  43.26 
 
 
555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
432 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
439 aa  319  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1075  phosphate regulon sensor protein PhoR  42.13 
 
 
434 aa  318  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000451223  normal  0.527296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
430 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
433 aa  315  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
442 aa  308  9e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  38.69 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  39.34 
 
 
431 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  40.58 
 
 
431 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
449 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  40.58 
 
 
431 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  40.58 
 
 
431 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  40.58 
 
 
431 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2267  histidine kinase  41.85 
 
 
472 aa  299  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  40.44 
 
 
431 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
431 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  40.19 
 
 
431 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  40.19 
 
 
431 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  41.65 
 
 
430 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  40.1 
 
 
431 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  40.69 
 
 
431 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  40.1 
 
 
431 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  40.1 
 
 
431 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  40.1 
 
 
431 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  38.83 
 
 
435 aa  295  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  39.46 
 
 
438 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  39.61 
 
 
431 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
448 aa  289  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  41.73 
 
 
438 aa  289  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
465 aa  289  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
465 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  40.96 
 
 
443 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  40.28 
 
 
440 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
460 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
431 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  40.59 
 
 
440 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  39.85 
 
 
438 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  39.91 
 
 
444 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
442 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
442 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  41.36 
 
 
440 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  39.13 
 
 
438 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  39.13 
 
 
438 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
464 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
432 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  38.89 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3105  phosphate regulon sensor protein  40.51 
 
 
440 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2215  histidine kinase  43.77 
 
 
356 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
442 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  39.51 
 
 
442 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
437 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  41.6 
 
 
436 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.6 
 
 
436 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  41.6 
 
 
436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  41.6 
 
 
436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.6 
 
 
436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  41.6 
 
 
436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>