176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4956 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  85.41 
 
 		 606 aa  1096    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1260    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  86.56 
 
 		 606 aa  1110    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  84.92 
 
 		 606 aa  1087    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  66.12 
 
 		 611 aa  873    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  85.9 
 
 		 606 aa  1096    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  39.71 
 
 		 611 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  39.71 
 
 		 611 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  39.97 
 
 		 611 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  39.71 
 
 		 611 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  39.55 
 
 		 611 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  39.55 
 
 		 611 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  39.71 
 
 		 611 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  38.42 
 
 		 616 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.84 
 
 		 590 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.84 
 
 		 590 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.6 
 
 		 612 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  38.97 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  38.93 
 
 		 612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  38.45 
 
 		 612 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  38.77 
 
 		 612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  38.77 
 
 		 612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  38.93 
 
 		 612 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  38.93 
 
 		 612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  36.06 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.12 
 
 		 605 aa  363  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  35.71 
 
 		 609 aa  362  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  35.67 
 
 		 619 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  36.48 
 
 		 593 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  35.62 
 
 		 619 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.88 
 
 		 619 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  35.47 
 
 		 589 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.38 
 
 		 623 aa  346  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  35.99 
 
 		 586 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  34.07 
 
 		 625 aa  334  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  34.13 
 
 		 623 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  34.13 
 
 		 623 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  34.13 
 
 		 623 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  34.13 
 
 		 623 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  34.13 
 
 		 623 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  34.13 
 
 		 623 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  33.97 
 
 		 623 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  33.17 
 
 		 623 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  32.43 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  33.82 
 
 		 592 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  33.86 
 
 		 628 aa  314  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  34.52 
 
 		 589 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  31.66 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  31.84 
 
 		 611 aa  306  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  32.49 
 
 		 623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.75 
 
 		 630 aa  303  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  33.65 
 
 		 624 aa  303  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  31.06 
 
 		 624 aa  300  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  33.98 
 
 		 587 aa  297  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.55 
 
 		 624 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  31.9 
 
 		 620 aa  296  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  33.17 
 
 		 597 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  33.17 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  33.72 
 
 		 597 aa  292  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  32.81 
 
 		 629 aa  289  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  31.49 
 
 		 588 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  32.18 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.19 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  31.66 
 
 		 588 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  32.1 
 
 		 638 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  31.82 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  32.79 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  31.22 
 
 		 629 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  33.66 
 
 		 577 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  32.03 
 
 		 626 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  32.03 
 
 		 626 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  32.03 
 
 		 626 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.79 
 
 		 588 aa  283  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  32.41 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  32.04 
 
 		 626 aa  281  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  33.12 
 
 		 596 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.41 
 
 		 629 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  31.73 
 
 		 626 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  31.88 
 
 		 626 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  31.88 
 
 		 626 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.71 
 
 		 588 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.31 
 
 		 588 aa  276  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  32.45 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  32.45 
 
 		 629 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  32.45 
 
 		 629 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.86 
 
 		 629 aa  273  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  31.81 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  31.88 
 
 		 595 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  32.29 
 
 		 629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  31.29 
 
 		 660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  32.29 
 
 		 629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  32.29 
 
 		 629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  32.29 
 
 		 629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  31.46 
 
 		 605 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  31.01 
 
 		 627 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  31.46 
 
 		 605 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  31.46 
 
 		 605 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  31.35 
 
 		 616 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  30.08 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  31.58 
 
 		 633 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>