More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4897 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5338  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4897  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0323  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  95.94 
 
 
197 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.352379  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4919  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  92.89 
 
 
197 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  hitchhiker  0.001484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0289  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  91.37 
 
 
210 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0309  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  91.37 
 
 
210 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7048  decreased coverage  0.00641142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  89.85 
 
 
197 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0314  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  90.86 
 
 
197 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  89.85 
 
 
197 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  88.83 
 
 
197 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  85.79 
 
 
197 aa  353  6.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  85.79 
 
 
197 aa  351  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0753  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  80.71 
 
 
197 aa  331  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  78.35 
 
 
195 aa  315  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.6 
 
 
197 aa  315  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  78.35 
 
 
195 aa  314  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.84 
 
 
195 aa  314  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.84 
 
 
195 aa  313  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.84 
 
 
195 aa  313  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.84 
 
 
195 aa  313  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.84 
 
 
195 aa  313  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.84 
 
 
195 aa  313  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.84 
 
 
195 aa  313  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  78.35 
 
 
195 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.32 
 
 
195 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.32 
 
 
195 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.32 
 
 
195 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.9 
 
 
196 aa  310  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.8 
 
 
195 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.62 
 
 
197 aa  310  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.9 
 
 
196 aa  310  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.9 
 
 
196 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.32 
 
 
195 aa  308  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.29 
 
 
195 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.29 
 
 
195 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.29 
 
 
195 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.29 
 
 
195 aa  307  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.63 
 
 
197 aa  307  8e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.62 
 
 
197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.77 
 
 
195 aa  305  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.26 
 
 
195 aa  305  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.26 
 
 
195 aa  304  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.47 
 
 
198 aa  303  9.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3382  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.23 
 
 
195 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915315  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.49 
 
 
206 aa  301  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.47 
 
 
202 aa  300  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.16 
 
 
195 aa  300  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.74 
 
 
195 aa  300  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.71 
 
 
201 aa  299  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.23 
 
 
195 aa  299  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.13 
 
 
195 aa  294  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0060  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.21 
 
 
208 aa  292  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.403359  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.04 
 
 
197 aa  290  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.92 
 
 
206 aa  288  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2443  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.23 
 
 
224 aa  288  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447729  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  67.71 
 
 
221 aa  287  9e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.902859  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.54 
 
 
199 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.54 
 
 
199 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.1 
 
 
199 aa  283  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  67.51 
 
 
198 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2805  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.53 
 
 
197 aa  279  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0730  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.28 
 
 
210 aa  276  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.28 
 
 
210 aa  276  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0148166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1032  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.92 
 
 
209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.637673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.31 
 
 
203 aa  269  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2948  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.13 
 
 
204 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.97 
 
 
197 aa  267  8e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4375  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  66.15 
 
 
210 aa  261  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.661676  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.91 
 
 
197 aa  254  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
198 aa  239  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.14 
 
 
209 aa  229  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.28 
 
 
198 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.85 
 
 
207 aa  228  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
198 aa  227  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.82 
 
 
236 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.14 
 
 
209 aa  225  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
201 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
201 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
213 aa  223  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
202 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
197 aa  221  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  221  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0092  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
204 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0089  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
204 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.922879  normal  0.290643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  220  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
195 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
201 aa  218  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.02 
 
 
198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  218  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  218  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
201 aa  217  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  217  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  216  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>