141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4873 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5313  molybdenum-pterin binding domain protein  100 
 
 
71 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4873  molybdenum-pterin binding protein  100 
 
 
71 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  94.37 
 
 
71 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  88.73 
 
 
71 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  88.73 
 
 
71 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  91.55 
 
 
71 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  91.55 
 
 
71 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  91.55 
 
 
90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  90.14 
 
 
71 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  90.14 
 
 
71 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  74.65 
 
 
71 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  77.46 
 
 
71 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2415  TOBE domain-containing protein  78.26 
 
 
74 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2971  TOBE domain protein  74.65 
 
 
71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  74.65 
 
 
71 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  74.65 
 
 
71 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  74.65 
 
 
71 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  71.83 
 
 
71 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  74.65 
 
 
71 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  73.24 
 
 
71 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  73.24 
 
 
71 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  73.24 
 
 
71 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  73.24 
 
 
71 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  73.24 
 
 
71 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  73.24 
 
 
71 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  73.24 
 
 
71 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  71.83 
 
 
71 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  71.83 
 
 
71 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  71.83 
 
 
71 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  73.24 
 
 
71 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  71.83 
 
 
71 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  71.83 
 
 
71 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  71.83 
 
 
71 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  71.83 
 
 
102 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  71.83 
 
 
71 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  70.42 
 
 
71 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0119  molybdenum-pterin binding protein II  73.61 
 
 
72 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148673  hitchhiker  0.000165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  64.79 
 
 
71 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0618  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  69.01 
 
 
71 aa  97.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000430997  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  53.12 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  53.12 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  47.69 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  50.77 
 
 
69 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 
66 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
68 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  47.69 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  43.55 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  44.12 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  44.62 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  44.62 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  36.36 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  38.46 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  46.15 
 
 
378 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
269 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.88 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  36.92 
 
 
69 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  37.5 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  43.55 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  40.62 
 
 
69 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  38.71 
 
 
142 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  44.62 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  35.38 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
274 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  42.37 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.51 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  43.08 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  43.08 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  42.19 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  33.85 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  38.71 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  43.08 
 
 
263 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
276 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  37.88 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  35.94 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  40.68 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.67 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  41.54 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  36.67 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  36.67 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  40.68 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  38.71 
 
 
268 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  40.62 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  40.62 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  36.92 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  32.31 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  32.31 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  43.08 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>